PROTEOMICS WORKBENCH
蛋白质组数据管理工具
覆盖原始数据清洗、处理结果整合与数据库浏览。全部操作在浏览器本地完成,源文件不会上传到服务器。
导入数据1清洗或合并2预览与导出
功能模块
选择当前所处的数据处理步骤
三个页面共享统一的数据格式与导出体验,可按实际工作流独立使用。
原始数据处理01
MaxQuant 清洗与合并
面向原始 MaxQuant 蛋白表。自动提取 Protein IDs 与 Intensity 列,过滤污染物和反向序列,并把多个批次合并为统一矩阵。
- Excel / CSV
- ComBat 批次校正
- CSV / Excel 导出
结果整理02
处理后结果再合并
面向已经处理完成的多个蛋白矩阵。以文件名标记来源样本列,按蛋白并集补零合并,可选简单批次对齐。
- 多文件合并
- 样本列前缀
- 缺失值补零
数据库浏览03
Parquet 数据浏览与导出
导入蛋白或肽段 Parquet 数据库,自动识别类型、勾选展示列、关键词筛选,并导出当前筛选结果。
- 蛋白 / 肽段识别
- 高丰度名单统计
- 全部结果导出
数据处理原则
Protein IDs 含多个条目时按第一个分号前条目处理;缺失的定量值按 0 保留。
Parquet 蛋白标记
指定高丰度名单中的蛋白以红色标记,其余蛋白以绿色标记;导出可选择仅保留首个条目。